Le réseau du microbiome des éponges marines assemblé

Définir l'organisation des réseaux d'interaction entre espèces et dévoiler les processus à l'origine de leur assemblage est fondamental pour comprendre les modèles de biodiversité, la stabilité des communautés et le fonctionnement des écosystèmes. C’est le défi que se sont lancés des chercheurs de la Station d’Écologie Théorique et Expérimentale de Moulis (UMR CNRS/UPS) auquel ils répondent en présentant le réseau d’assemblage du microbiome des éponges dans un article paru dans Nature Communications.

Les éponges marines hébergent des communautés complexes de micro-organismes qui contribuent à leur santé et à leur survie, mais les mécanismes à la base de l'assemblage du microbiome sont en grande partie inconnus. Dans cet article, les chercheurs ont présenté le réseau mondial d'éponges et de microbiomes marins. Ils révèlent une organisation modulaire, à la fois en termes de structure et de fonction des communautés. Les modules sont liés par quelques espèces d'éponges qui partagent des microbes avec d'autres espèces du monde entier.

Le microbiome, qu’est-ce que c’est ?

Le microbiome est une communauté de microorganismes (tels que les bactéries, les champignons et les virus) qui habitent un environnement particulier et dans le cas particulier des éponges, l'ensemble des des microorganismes vivant dans les éponges.

Les auteurs ont également pu apporter la preuve que tous les microbes présents sont influencés par des facteurs abiotiques (facteurs physico-chimiques de l’écosystème) qui influencent la structuration du microbiome de l’éponge, mais que les interactions biotiques (action des organismes vivants sur le vivant) conditionnent l’assemblage de micro-organismes «de base» plus intimement associés.

Ces résultats suggèrent que des processus écologiques et évolutifs sont en jeu dans l'assemblage du réseau hôte-microbe. Les auteurs s’attendent à ce que les mécanismes impliqués dans cet assemblage soient cohérents sur tous les hôtes multicellulaires de l'arbre de la vie.

Voir aussi

Miguel Lurgi, Torsten Thomas, Bernd Wemheuer, Nicole S. Webster & Jose M. Montoya. Modularity and predicted functions of the global sponge-microbiome network. Nature Communications (2019) 10:992 https://doi.org/10.1038/s41467-019-08925-4 | www.nature.com/naturecommunications